La productivité peut être considérablement augmentée grâce aux cultures en mode continu (ou chemostat). De plus, ce mode de travail vous économise les temps morts nécessaires pour le démontage et remontage du bioréacteur en mode batch (culture discontinue) ainsi que les longs temps de croissances des cultures cellulaires.
En mode continu, lorsque le système atteint l'équilibre, l'ajout de milieu de culture, nécessaire au maintien d'une croissance optimale, est compensé par l'évacuation d'une quantité équivalente de milieu de culture. Ainsi, la quantité de milieu dans le bioréacteur reste constante.
Pour permettre un travail précis il est nécessaire de contrôler la quantité de milieu en terme de poids et non pas en volume qui varie, entres autres, en fonction de la température, de la pression, de la formation de mousse, de l'aération et de l'agitation.